RNACast — это онлайн-сервис и набор инструментов для прогнозирования и анализа вторичной структуры РНК, включая классификацию структурных мотивов и прогнозы на основе машинного обучения. Сервис предоставляет пользователям возможность анализировать РНК-последовательности, предсказывать их вторичную структуру и выявлять функционально значимые элементы, такие как псевдозвенья и структурные мотивы, что важно для исследований в области биоинформатики и молекулярной биологии.
С помощью RNACast исследователи могут проводить анализ последовательностей РНК, выявлять потенциальные структурные элементы и оценивать их стабильность. Это особенно полезно при изучении функциональных элементов РНК, таких как сайты связывания белков, регуляторные элементы и участки, участвующие в формировании трехмерной структуры молекулы. Использование машинного обучения позволяет повышать точность прогнозов и адаптировать модели под специфические задачи.
- Прогнозирование вторичной структуры РНК с использованием алгоритмов машинного обучения.
- Классификация структурных мотивов и элементов РНК.
- Идентификация функционально значимых участков в последовательностях РНК.
- Оценка стабильности предсказанных структур и их соответствия экспериментальным данным.
- Предоставление инструментов для визуализации и анализа результатов прогнозирования.